Научный сотрудник в подразделение «научно-учебная лаборатория био- и хемоинформатики»

Срок работы: 1 год с возможностью продления на второй. Мы, Высшая школа экономики – один из крупнейших университетов России, ведущий центр образования, научных исследований и разработок. Сегодня в Вышке учится более 47 000 студентов и аспирантов, работает более 7000 преподавателей, ученых и административных сотрудников. В настоящее время у нас открыт конкурс Программы привлечения российских постдоков. В рамках конкурса открыты вакансии постдока (научного сотрудника) в подразделении «научно-учебная лаборатория био- и хемоинформатики». ПРОЕКТ 1: Рациональный дизайн низкомолекулярных соединений для терапии злокачественных новообразований. Цель проекта: Разработка и оценка целевой биологической активности малых молекул, направленных на специфическое связывание с рецепторами, отвечающими за подавление иммунного ответа, т.н. контрольные точки иммунного ответа. Ингибиторы контрольных точек иммунитета действуют путем нарушения ингибирующих сигналов от неопластических клеток к иммунным эффекторным клеткам, что позволяет активированным Т-клеткам атаковать опухолевые клетки. Задачи в рамках проекта: 1) Анализ структуры исследуемых белков, аффилированных с контрольными точками иммунной системы; 2) Анализ структур существующих ингибиторов, обладающих экспериментально подтверждённой активностью в отношении соответствующих рецепторов; 3) Параметризация процесса связывания как контрольных, так и исследуемых соединений с помощью методов молекулярного моделирования; 4) Дизайн новых малых молекул целевой направленности; 5) Синтез исследуемых малых молекул с высокой предсказанной активностью, их валидация на соответствующих тест-системах. Что мы ждем от успешных кандидатов на данную должность: Ученая степень (Ученая степень кандидата наук, успешная защита кандидатской диссертации, степень PhD) Что мы предлагаем: Доступ к информационным ресурсам, базам данных и электронным подпискам НИУ ВШЭ Доступ к вычислительным серверам через VPN Оборудованное рабочее место в университете (в Санкт-Петербурге, на Кантемировской 3) ПРОЕКТ 2: Молекулярный дизайн, синтез, идентификация и биологическая активность новых ингибиторов Akt-киназы человека для терапии онкологических заболеваний. Цель проекта: Проведение комплексного фундаментального исследования, направленного на разработку научных принципов создания и молекулярное конструирование биологически активных соединений на основе ингибиторов Akt-киназ человека. Задачи в рамках проекта: Поиск и дизайн новых ингибиторов Akt-киназы, отсев потенциально активных структур Изучение с использованием молекулярного моделирования динамики лиганд-белковых комплексов для оценки соотношений структура-активность Синтез новых ингибиторов Akt-киназы человека Идентификация синтезированных соединений методами инфракрасной спектроскопии, ЯМР-спектроскопии, электронной спектроскопии, элементного анализа Изучение цитотоксичности синтезированных соединений и их влияния на пролиферацию здоровых (HEK293) и опухолевых клеток (глиобластома, HeLa, аденокарцинома печени, карцинома легких, тератокарцинома яичника) Изучение генотоксичности и гемосовместимости полученных соединений Исследование in vitro взаимодействия синтезированных соединений с ДНК и белками Что мы ждем от успешных кандидатов на данную должность: Ученая степень (Ученая степень кандидата наук, успешная защита кандидатской диссертации, степень PhD) Знание органической или медицинской химии, навыки работы с ПО для компьютерного молекулярного конструирования и понимание основных принципов рационального драг дизайна. Готовность вести несколько смежных проектов